Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CsprsQ99388 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CsprsQ99388 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms