Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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