Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms