Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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