Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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