Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Vmn1r200Q8R281 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Vmn1r200Q8R281 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Vmn1r200Q8R281 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Vmn1r200Q8R281 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Vmn1r200Q8R281 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Vmn1r200Q8R281 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Vmn1r200Q8R281 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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