Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcsapQ8QZT2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms