Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec12Q8K4Q8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec12Q8K4Q8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Colec12Q8K4Q8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec12Q8K4Q8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Colec12Q8K4Q8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Colec12Q8K4Q8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Colec12Q8K4Q8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec12Q8K4Q8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec12Q8K4Q8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Colec12Q8K4Q8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Colec12Q8K4Q8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Colec12Q8K4Q8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Colec12Q8K4Q8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Colec12Q8K4Q8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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