Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mkl1Q8K4J6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mkl1Q8K4J6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms