Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms