Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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