Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms