Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sde2Q8K1J5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms