Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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