Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cdc34Q8CFI2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms