Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pramef8Q8CE24 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pramef8Q8CE24 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pramef8Q8CE24 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pramef8Q8CE24 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pramef8Q8CE24 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms