Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms