Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfibp1Q8C8U0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms