Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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