Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod1Q8BVA4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod1Q8BVA4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms