Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rd3Q8BRE0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rd3Q8BRE0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rd3Q8BRE0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rd3Q8BRE0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rd3Q8BRE0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rd3Q8BRE0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rd3Q8BRE0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rd3Q8BRE0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rd3Q8BRE0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rd3Q8BRE0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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