Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Smarcal1Q8BJL0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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