Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca8Q8BHX3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca8Q8BHX3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms