Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf41Q8BH75 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms