Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Atg4dQ8BGV9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atg4dQ8BGV9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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