Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atg4bQ8BGE6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atg4bQ8BGE6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atg4bQ8BGE6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atg4bQ8BGE6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Atg4bQ8BGE6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms