Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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