Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf187Q8BFX1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms