Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms