Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms