Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms