Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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NischQ80TM9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
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