Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PhkbQ7TSH2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms