Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms