Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Scn4bQ7M729 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Scn4bQ7M729 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scn4bQ7M729 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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