Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl2Q78Y63 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdcl2Q78Y63 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl2Q78Y63 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl2Q78Y63 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdcl2Q78Y63 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms