Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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