Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmed3Q78IS1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed3Q78IS1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms