Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme8Q715T0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms