Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms