Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx13Q6PHS6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms