Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvoplQ6PDF3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms