Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp49Q6P9L4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms