Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpm4Q6IRU2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms