Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg9aQ68FE2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms