Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tpgs2Q66JT5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms