Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja3Q64448 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja3Q64448 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms