Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms