Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms