Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms